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首頁技術(shù)文章利用超聲波DNA打斷儀進(jìn)行NGS建庫有哪些優(yōu)勢?

利用超聲波DNA打斷儀進(jìn)行NGS建庫有哪些優(yōu)勢?

更新時間:2023-06-05      瀏覽:1409次
超聲波DNA打斷儀,用于把DNA片段切斷建庫。建庫,即文庫制備,是指將樣本處理成可被測序儀讀取的DNA片段,該片段需滿足一定的長度,且在兩端都連接了指定的序列(錨定序列、測序引物序列、標(biāo)簽序列等)。

超聲波DNA打斷儀通過壓電轉(zhuǎn)換器,將電信號轉(zhuǎn)變?yōu)楦哳l聲波信號,產(chǎn)生數(shù)百萬的水分子”空穴”,利用“空穴” 在幾微秒內(nèi)變大、破裂產(chǎn)生的瞬時流體剪切力,通過等溫、非接觸的方式對樣品進(jìn)行打斷、勻漿和混合。


超聲法優(yōu)勢在于打斷的DNA片段更為集中且無偏好性,是目前NGS建庫中片段化的金標(biāo)準(zhǔn)??稍诿荛]容器、無菌、可超微量條件下進(jìn)行破碎。相比傳統(tǒng)的探頭超聲波細(xì)胞粉碎機,該儀器具有一次可同時檢測多個樣品、實驗效率高、無需頻繁操作探頭、避免樣本交叉污染等優(yōu)勢。儀器標(biāo)配低溫恒溫裝置(雙循環(huán)恒溫裝置),便于樣品在4-10℃環(huán)境內(nèi)工 作,使能量分布均勻,超聲作用。逐漸成為ChIP(染色質(zhì)免疫共沉淀)和DNA剪切研究平臺必要的標(biāo)準(zhǔn)化工具。

 

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